国家精品资源共享课建设项目自十二五正式启动以来，在数量和规模上都达到了计划目标，形成了国家、省、校三级为一体的结构体系，取得了丰硕成果。国家精品资源共享课类别众多，涉及文学、历史学、哲学、经济学、管理学、法学、教育学、理学、工学、农学、医学以及其他各类学科，各类下又有细小分支。虽然经过近4年的努力，国家精品资源共享课项目获得了可喜成绩，但存在的问题也日益突出：
（1）交互程度低。“教学交互是一种发生在学习和学习环境之间的事件”，学生能够进入真正的对话、分析和回应过程中，其过程越成功,交互质量越高。目前国家精品资源共享课交互程度偏低，留言回复寥寥无几，也不支持同步交互，学习者反映的问题无法得到解决，极大影响继续学习的热情。
（2）优质教学资源短缺。有意义学习是“将符号代表的新知识与学习者认知结构中已有的适当观念建立非人为和实质性的联系”，这种意义学习首先要保证学习材料具有实际意义，而优质教学资源正是实现有意义学习的基石。目前国家精品资源共享课的优质教学资源建设还不完善，资源重复率高利用率低，部分资源只为了凑数而不讲究质量，难以满足学习者的学习需求。
（3）重评审轻利用。我国精品资源共享课建设“行政主导，自上而下开展”的运作方式使得“国家精品资源共享课”称号成为高校教学改革成果的一个重要标志。大部分课程只是为评而建，在通过评审后没有持续建设和完善。据调查，很多高校学生对国家精品资源共享课一无所知，更别说有效利用，大大背离了教育部建设精品资源共享课项目的初衷，浪费了教育资源。
（4）推广和共享程度低。国家精品资源共享课资源的推广与共享是2005 年以来高等教育课程研究领域和高等学校课程建设关注的焦点和核心。国家精品资源共享课对广大学习者群体半开放，实行积分限制，而积分的累积条件对学习者来说难度太大，因此大部分资源都只能在线浏览，极大限制了资源的共享和推广。
近年来受到慕课的影响，国家精品资源共享课兴起了视频公开课热潮，逐步表现出对学习者能力培养的高度重视，但在培养创新人才方面仍缺乏有效机制，无法提高课程平台与学生创新能力培养的关联度。
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